扫描电镜的图象显示在阴极射线管(显像管)上，并由照相机拍照记录，显像管有两个，一个用来观察，分辨率较低；另一个用来照相记录，分辨率较高。

　　显像管中的电子束在荧光屏上也作光栅状扫描，并且这种扫描运动与样品表面的电子束的扫描运动严格同步，这样即获得衬度与所接收信号强度相对应的扫描电子像，这种图象反映了样品表面的形貌特征。生物样品制备技术大多数生物样品都含有水分，而且比较柔软，因此，在进行电镜观察前，要对样品作相应的处理，主要要求是使样品的表面结构保存好，没有变形和污染，样品干燥并且有良好导电性能。

　　电镜的真空系统由机械泵与油扩散泵组成，其作用是使镜筒内达到真空度，电源系统供给各部件所需的特定的电源。

　　和光学显微镜及透射电镜相比，扫描电镜具有以下特点：

　　(一)能够直接观察样品表面的结构，样品的尺寸可大至120mm×80mm×50mm。

　　(二) 样品制备过程简单，不用切成薄片。

　　(三) 样品可以在样品室中作三度空间的平移和旋转，因此，可以从各种角度对样品进行观察。

　　(四) 景深大，图象富有立体感。景深较光学显微镜大几百倍，比透射电镜大几十倍。

　　(五) 图象的放大范围广，分辨率也比较高。可放大十几倍到几十万倍，它基本上包括了从放大镜、光学显微镜直到透射电镜的放大范围。分辨率介于光学显微镜与透射电镜之间，可达3nm。

　　(六) 电子束对样品的损伤与污染程度较小。

　　(七) 在观察形貌的同时，还可利用从样品发出的其他信号作微区成分分析。